Kryogenická postseparační úprava polyakrylamidových gelů pro metaloproteomické analýzy kombinací gelové elektroforézy, laserové ablace a hmotnostní spektrometrie s ionizací indukčně vázaným plazmatem

Autoři

  • Hana Ovadová-Nejezchlebová Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, Ústav chemie, Oddělení analytické chemie, Laboratoř atomové spektrochemie, Brno, Česká republika
  • Tomáš Vaculovič Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, Ústav chemie, Oddělení analytické chemie, Laboratoř atomové spektrochemie, Brno, Česká republika
  • Paul Ek Åbo Akademi University, Laboratory of Analytical Chemistry, Åbo (Turku), Finsko
  • Jan Havliš Masarykova univerzita, Středoevropský technologický institut, Mendelovo centrum genomiky a proteomiky rostlin, Proteomika CF, Brno, Česká republika | Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, Ústav experimentální biologie, Oddělení funkční genomiky a proteomiky, Centrální laboratoř, Brno, Česká republika
  • Viktor Kanický Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, Ústav chemie, Oddělení analytické chemie, Laboratoř atomové spektrochemie, Brno, Česká republika | Masarykova univerzita, Středoevropský technologický institut, Centrum nano- a mikrotechnologií, Laboratoř syntézy a analýzy nanostruktur, Brno, Česká republika

Klíčová slova:

gelová elektroforéza, laserová ablace, indukčn¬ě vázané plazma, hmotnostní spektrometrie, metaloprotein, kov vázající protein, kryogenická ablační cela, celofánová fólie, sušení gelu

Abstrakt

Analysis of metal species in cryogenic frozen gels originated in polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) by laser ablation (LA) connected to inductively coupled plasma mass spectrometry (ICP-MS) – GLIM in abbreviation – has been investigated to detect/quantitate them in separated metalloproteins. It was compared to traditional ways of gel drying procedures prior to ablation (plain drying, drying gel sandwiched between two cellophane foils), which are necessary operations before laser ablation to prevent undesired interferences related to gas production during laser ablation because of liquid content. Laser ablation of the gels containing BSA:Co(II) 1:1 and ADH with Zn(II) in cryogenic ablation cell (at –80 °C for 25 min) is a relevant alternative to the traditional procedures because of significant time spared during the procedure (down to tens of hours instead of days), it yields comparable outcome of metal species analysis by means of their high signal intensities and low RSD in ICP-MS and because of reusability of gels after cryogenic ablation, e.g. for mass spectrometry driven identification of protein moiety of metalloprotein.

Stahování

Publikováno

15.11.2011

Jak citovat

Ovadová-Nejezchlebová, H., Vaculovič, T., Ek, P., Havliš, J., & Kanický, V. (2011). Kryogenická postseparační úprava polyakrylamidových gelů pro metaloproteomické analýzy kombinací gelové elektroforézy, laserové ablace a hmotnostní spektrometrie s ionizací indukčně vázaným plazmatem. Chemické Listy, 105(11), 896–902. Získáno z http://ww.w.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/1036

Číslo

Sekce

Články