Lineární reprezentace chemických struktur

Autoři

  • J. Jirát CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Ústav molekulární genetiky AV ČR v.v.i., Praha | CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Laboratoř informatiky a chemie, Fakulta chemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Praha
  • D. Svozil CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Ústav molekulární genetiky AV ČR v.v.i., Praha | CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Laboratoř informatiky a chemie, Fakulta chemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Praha

Klíčová slova:

lineární reprezentace, SMILES, InChI, InChIKey, SMARTS

Abstrakt

An overview and description of the most used linear structure representations and identifiers based on 2D representation of molecule structures (SMILES, InChI, InChIKey) is given. For each type the following is described: algorithm for their generation, notation, basic principles of stereochemistry encoding, suitability for data transfer of chemical structures and for use as unique identifier. Format SMARTS (description of substructures and generic atoms/groups/bonds) is also briefly introduced.

Stahování

Publikováno

15.11.2017

Jak citovat

Jirát, J., & Svozil, D. (2017). Lineární reprezentace chemických struktur. Chemické Listy, 111(11), 710–715. Získáno z http://ww.w.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/2810

Číslo

Vol 111 No 11 (2017)

Sekce

Články